MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.02

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019696	GCTC	2	8	40	47	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019696	AAGGGG	2	12	106	117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019696	GCT	2	6	137	142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019696	AGC	2	6	158	163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019696	GGCAA	2	10	234	243	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019696	CCA	2	6	269	274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_019696	GTG	2	6	286	291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019696	CTAG	2	8	324	331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019696	ACT	2	6	363	368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019696	AAAG	2	8	371	378	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019696	TAG	2	6	488	493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428210483
12	NC_019696	TAC	2	6	521	526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210483
13	NC_019696	ACT	2	6	561	566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210483
14	NC_019696	T	7	7	604	610	0 %	100 %	0 %	0 %	428210483
15	NC_019696	ATT	2	6	611	616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428210483
16	NC_019696	CCA	2	6	651	656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428210483
17	NC_019696	ATT	2	6	697	702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019696	TTC	2	6	738	743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428210484
19	NC_019696	ATC	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210484
20	NC_019696	TC	3	6	773	778	0 %	50 %	0 %	50 %	428210484
21	NC_019696	ACC	2	6	788	793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428210484
22	NC_019696	CTC	3	9	861	869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428210484
23	NC_019696	TTC	2	6	880	885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428210484
24	NC_019696	TCAAC	2	10	932	941	40 %	20 %	0 %	40 %	428210484
25	NC_019696	TAG	2	6	1004	1009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428210484
26	NC_019696	CAG	2	6	1031	1036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428210484
27	NC_019696	CTA	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210484
28	NC_019696	TGC	2	6	1108	1113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428210484
29	NC_019696	CTG	2	6	1131	1136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428210484
30	NC_019696	TCTT	2	8	1147	1154	0 %	75 %	0 %	25 %	428210484
31	NC_019696	CAT	2	6	1173	1178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210484
32	NC_019696	TC	3	6	1312	1317	0 %	50 %	0 %	50 %	428210484
33	NC_019696	GC	3	6	1365	1370	0 %	0 %	50 %	50 %	428210484
34	NC_019696	GCA	2	6	1384	1389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428210484
35	NC_019696	CGC	2	6	1435	1440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428210484
36	NC_019696	TGC	2	6	1479	1484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428210484
37	NC_019696	CAT	2	6	1508	1513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210484
38	NC_019696	GAT	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428210484
39	NC_019696	ACT	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019696	TTGA	2	8	1822	1829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019696	A	6	6	1956	1961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019696	TAT	2	6	2086	2091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019696	CG	5	10	2104	2113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019696	CAA	2	6	2188	2193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019696	CAA	2	6	2326	2331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019696	TTG	2	6	2400	2405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019696	TA	3	6	2411	2416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019696	CGC	2	6	2420	2425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_019696	CTA	2	6	2427	2432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019696	A	6	6	2531	2536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019696	GCT	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019696	TAGC	2	8	2720	2727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019696	CCTTCC	2	12	2758	2769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.